蛋白质数据库简介

zhangyongling

edited by Yuqin：
1.PIR（Protein Information Resource）数据库
功能：蛋白质序列数据；蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来源；关于原始数据的参考文献；蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因表达、翻译后处理、活化等；序列中相关的位点、功能区域。

2.UniProt Knowledgebase数据库
由两部分组成: UniProtKB/Swiss-Prot; UniProtKB/TrEMBL
功能：UniProtKB/Swiss-Prot中，序列数据、参考文献、分类信息（蛋白质生物来源的描述）；蛋白质的功能描述；翻译后修饰；域和功能位点，如钙结合区域、ATP结合位点等；蛋白质的二级结构；蛋白质的四级结构，如同构二聚体、异构三聚体等；与其它蛋白质的相似性；由于缺乏该蛋白质而引起的疾病；序列的矛盾、变化等。

UniProtKB/TrEMBL包含从EMBL核酸数据库中根据编码序列(CDS)翻译而得到的蛋白质序列，并且这些序列尚未集成到SWISS-PROT数据库中。

3.蛋白质结构数据库  
PDB
NCBI structure

4、蛋白质分类数据库  
SCOP
CATH